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El género Eucalyptus, perteneciente a la familia de las Mirtáceas, es un grupo de árboles muy diverso con más de 800 especies. Además de ser árboles económicamente trascendentes, los Eucalyptus son un ejemplo de radiación adaptativa. A partir del Cenozoico medio (hace 25 a 10 millones de años), las especies del género se diversificaron, adaptándose a numerosos nichos ecológicos y a una gran variedad de climas. Sin embargo, la enorme variedad de especies contrasta con la similitud de sus genomas, los cuales muestran un gran grado de conservación y no presentan grandes rearreglos cromosómicos. Estudios genómicos apuntan a las duplicaciones en tándem como principal mecanismo evolutivo para explicar la gran diversidad del género. Sin embargo, estos trabajos fueron realizados en E. grandis y E. globulus, por lo que resulta sumamente interesante y necesario determinar hasta qué punto ésta característica se extiende a otras especies de Eucalyptus. En este proyecto pretendemos estudiar las duplicaciones génicas en varias especies de Eucalyptus, así como identificar los genes localizados en las regiones duplicadas. Para llevar a cabo este objetivo, secuenciaremos los genomas de 10 especies de Eucalyptus, incluyendo a E. grandis que será utilizado como control al compararlo con trabajos previos. Posteriormente, identificaremos los genes asociados a las regiones que presenten una variación en el número de copias entre especies utilizando softwares específicos (e.g., cn.mops, DELLY y LUMPY). Utilizaremos el genoma de E. grandis como referencia, dado que está extensamente curado y anotado. Finalmente, como estrategia complementaria, los resultados bioinformáticos serán examinados mediante qPCR para genes claves (e.g., factores de transcripción). Los aportes de este proyecto ayudarían a comprender el rol de las duplicaciones génicas en la evolución y adaptación de los Eucalyptus.

El género Eucalyptus agrupa a más de 800 especies de árboles de gran importancia económica que representan un claro ejemplo de rápida adaptación a diversos climas y nichos ecológicos a lo largo de millones de años. Sorprendentemente, a pesar de su enorme diversidad, sus genomas son muy similares. La hipótesis principal es que su rápida evolución está impulsada por las duplicaciones génicas en tándem, es decir, que ciertos genes se copian repetidamente en una región del ADN. Como esta idea se ha estudiado solo en unas pocas especies, nuestro proyecto se propuso determinar si esta característica es común a más miembros del género. Para ello, secuenciamos y analizamos los genomas de 11 especies de Eucalyptus. Los resultados de esta investigación son útiles para comprender el rol de estas duplicaciones en la evolución y adaptación del género, y la información obtenida puede ser aplicable en programas de mejoramiento genético de eucaliptos.